在制药行业，过滤有着重要作用。
在药品生产过程中，空气过滤用于保证洁净车间的空气质量，防止空气中的尘埃、微生物等污染药品；液体过滤用于药液的过滤，去除其中的杂质、微生物等，确保药液的纯净度和稳定性。
在生物制药中，过滤用于分离和纯化生物制品，如蛋白质、疫苗等。
过滤也用于制药用水的处理，保障水的质量符合制药要求。
在无菌制剂生产中，有效过滤用于实现无菌环境的维持。
此外，一些特殊的过滤技术还可用于去除特定的有害物质或分离特定成分，以满足不同制药工艺的需求。